خبراء المعلوماتية الحيوية

ما ستفعله:

• إكمال مهام واقعية متعددة الخطوات لتحليل البيانات العلمية في مجال المعلوماتية الحيوية

• كتابة أسئلة أصلية في المعلوماتية الحيوية بحيث تكون كل إجابة دقيقة وموضوعية

• اختيار وإخفاء هوية البيانات (على سبيل المثال من الأرشيفات العامة مثل GEO أو SRA/ENA أو ArrayExpress أو PRIDE أو PDB أو MGnify أو من بيانات المختبر غير المنشورة الخاصة بك) ليقوم النموذج بتحليلها

• استخدام البرمجيات العلمية، والشيفرات البرمجية، وأدوات سطر الأوامر لإنشاء تحليلات قابلة للاستنساخ ومخرجات نهائية منظمة

• تطوير دفتر ملاحظات Jupyter للتحقق، وتحليل البيانات بلغة Python أو R، مما يعيد إنتاج الإجابة الصحيحة لسؤالك

• تفسير النتائج في سياق السؤال البيولوجي أو الانتقالي الأساسي، مع التواصل بوضوح بشأن الافتراضات، وعدم اليقين، والاستنتاجات

من نبحث عنه:

• درجة الماجستير أو الدكتوراه (أو خبرة بحثية معادلة) في المعلوماتية الحيوية، أو البيولوجيا الحاسوبية، أو علم الجينوم، أو الوراثة الإحصائية، أو البيولوجيا الكمية، أو مجال ذي صلة وثيقة

• خبرة عملية في تحليل بيانات التسلسل والأوميكس (RNA-seq الجماعي أو الخلوي المفرد، WGS/WES، استدعاء المتغيرات، الميتاجينوميات، البروتينات أو ما شابه)، بدءاً من القراءات الأولية وصولاً إلى التفسير

• خبرة في واحد أو أكثر من الأدوات التالية: samtools، وbcftools، وbedtools، وBWA، وBowtie2، وBLAST، بالإضافة إلى Python (pandas، وBiopython، وpysam) أو R/Bioconductor (DESeq2، وedgeR، وlimma، وGenomicRanges)

• القدرة على كتابة وتشغيل دفاتر ملاحظات Jupyter التي تعيد إنتاج عملك بدقة

• كتابة علمية واضحة ودقيقة

• الوصول إلى مجموعات بيانات غير منشورة أو خاصة لديك الحق في مشاركتها يُعد ميزة إضافية قوية

• معرفة عميقة في مجال متخصص واحد على الأقل، مثل كائن حي غير نموذجي، أو مقايسة غير عادية، أو مجال متخصص للتفسير الجينومي يُعد ميزة إضافية قوية