Esperti di Bioinformatica

Cosa farai:

• Completare compiti realistici e multi-fase di analisi di dati scientifici in bioinformatica

• Scrivere domande originali di bioinformatica in cui ogni risposta sia esatta e oggettiva

• Scegliere e rendere anonimi i dati (ad es. da archivi pubblici come GEO, SRA/ENA, ArrayExpress, PRIDE, PDB, MGnify o dai tuoi dati di laboratorio inediti) affinché il modello li analizzi

• Utilizzare software scientifici, codice e strumenti da riga di comando per generare analisi riproducibili e risultati finali strutturati

• Sviluppare un notebook di convalida Jupyter, analizzando i dati in Python o R, che riproduca la risposta corretta alla tua domanda

• Interpretare i risultati nel contesto della domanda biologica o traslazionale sottostante, comunicando chiaramente ipotesi, incertezze e conclusioni

Chi stiamo cercando:

• Laurea magistrale o dottorato (o esperienza di ricerca equivalente) in bioinformatica, biologia computazionale, genomica, genetica statistica, biologia quantitativa o in un campo strettamente correlato

• Esperienza pratica nell'analisi di dati di sequenziamento e omici (RNA-seq bulk o a singola cellula, WGS/WES, variant calling, metagenomica, proteomica o simili), dalle letture grezze all'interpretazione

• Esperienza con uno o più dei seguenti strumenti: samtools, bcftools, bedtools, BWA, Bowtie2, BLAST, oltre a Python (pandas, Biopython, pysam) o R/Bioconductor (DESeq2, edgeR, limma, GenomicRanges)

• Capacità di scrivere ed eseguire notebook Jupyter che riproducano esattamente il tuo lavoro

• Scrittura scientifica chiara e precisa

• L'accesso a dataset inediti o privati che hai il diritto di condividere costituisce un forte vantaggio

• Una profonda conoscenza di almeno un'area di nicchia, come un organismo non modello, un test insolito o un'area specializzata di interpretazione genomica, costituisce un forte vantaggio