Expertos en Bioinformática

Lo que harás:

• Completar tareas científicas realistas de análisis de datos de múltiples pasos en bioinformática

• Escribir preguntas bioinformáticas originales en las que cada respuesta sea exacta y objetiva

• Elegir y anonimizar datos (por ejemplo, de archivos públicos como GEO, SRA/ENA, ArrayExpress, PRIDE, PDB, MGnify o de tus propios datos de laboratorio no publicados) para que el modelo los analice

• Utilizar software científico, código y herramientas de línea de comandos para generar análisis reproducibles y resultados finales estructurados

• Desarrollar un cuaderno de validación de Jupyter, analizando los datos en Python o R, que reproduzca la respuesta correcta a tu pregunta

• Interpretar los resultados en el contexto de la pregunta biológica o traslacional subyacente, comunicando claramente las suposiciones, la incertidumbre y las conclusiones

A quién buscamos:

• Máster o doctorado (o experiencia de investigación equivalente) en bioinformática, biología computacional, genómica, genética estadística, biología cuantitativa o un campo estrechamente relacionado

• Experiencia práctica en el análisis de datos de secuenciación y ómicas (RNA-seq masivo o de célula única, WGS/WES, llamada de variantes, metagenómica, proteómica o similares), desde las lecturas sin procesar hasta la interpretación

• Experiencia con una o más de las siguientes herramientas: samtools, bcftools, bedtools, BWA, Bowtie2, BLAST, además de Python (pandas, Biopython, pysam) o R/Bioconductor (DESeq2, edgeR, limma, GenomicRanges)

• Capacidad para escribir y ejecutar cuadernos de Jupyter que reproduzcan tu trabajo exactamente

• Redacción científica clara y precisa

• El acceso a conjuntos de datos no publicados o privados que tengas derecho a compartir es una gran ventaja

• Un profundo conocimiento de al menos un área de especialización, como un organismo no modelo, un ensayo inusual o un área especializada de interpretación genómica, es una gran ventaja