BioInformatics Experts

Was Sie tun werden:

• Absolvieren Sie realistische, mehrstufige wissenschaftliche Datenanalyseaufgaben in der Bioinformatik

• Schreiben Sie originelle bioinformatische Fragestellungen, bei denen jede Antwort exakt und objektiv ist

• Wählen und anonymisieren Sie Daten (z. B. aus öffentlichen Archiven wie GEO, SRA/ENA, ArrayExpress, PRIDE, PDB, MGnify oder aus Ihren eigenen unveröffentlichten Labordaten) zur Analyse durch das Modell

• Verwenden Sie wissenschaftliche Software, Code und Kommandozeilentools, um reproduzierbare Analysen und strukturierte Endergebnisse zu generieren

• Entwickeln Sie ein Jupyter-Validierungsnotebook, das die Daten in Python oder R analysiert und die korrekte Antwort auf Ihre Frage reproduziert

• Interpretieren Sie Ergebnisse im Kontext der zugrundeliegenden biologischen oder translationalen Fragestellung und kommunizieren Sie Annahmen, Unsicherheiten und Schlussfolgerungen klar

Wen wir suchen:

• Master oder Promotion (oder äquivalente Forschungserfahrung) in Bioinformatik, Computational Biology, Genomik, statistischer Genetik, quantitativer Biologie oder einem eng verwandten Fachgebiet

• Praktische Erfahrung in der Analyse von Sequenzierungs- und Omics-Daten (Bulk- oder Single-Cell-RNA-Seq, WGS/WES, Variant Calling, Metagenomik, Proteomik oder ähnlich) von Rohreads bis zur Interpretation

• Erfahrung mit einem oder mehreren der folgenden Tools: samtools, bcftools, bedtools, BWA, Bowtie2, BLAST sowie Python (pandas, Biopython, pysam) oder R/Bioconductor (DESeq2, edgeR, limma, GenomicRanges)

• Fähigkeit, Jupyter-Notebooks zu schreiben und auszuführen, die Ihre Arbeit exakt reproduzieren

• Klares, präzises wissenschaftliches Schreiben

• Zugriff auf unveröffentlichte oder private Datensätze, die Sie weitergeben dürfen, ist ein starkes Plus

• Fundierte Kenntnisse in mindestens einem Nischenbereich, wie zum Beispiel einem Nicht-Modellorganismus, einem ungewöhnlichen Assay oder einem spezialisierten Bereich der Genominterpretation, sind ein starkes Plus